臭氧屬于有害氣體，濃度為6.25×10^-6mol/L（0.3mg/m³）時(shí)，對(duì)眼、鼻、喉有刺激的感覺；濃度（6.25～62.5）×10^-5mol/L（3～30mg/m³）時(shí)，出現(xiàn)頭疼及呼吸器官局部麻痹等癥；臭氧濃度為3.125×10^-4～1.25×10^-3 mol/L（15～60mg/m³） 時(shí)，則對(duì)人體有危害。其毒性還和接觸時(shí)間有關(guān)，例如長(zhǎng)期接觸1.748×10^-7mol/L（4ppm）以下的臭氧會(huì)引起永久性心臟障礙，但接觸20ppm以下的臭氧不超過2h，對(duì)人體無永久性危害。因此，臭氧濃度的允許值定為4.46×10^-9mol/L（0.1ppm）8h。由于臭氧的臭味很濃，濃度為4.46×10^-9mol/L（0.1ppm）時(shí)，人們就感覺到，因此，世界上使用臭氧已有一百多年的歷史，至今也沒有發(fā)現(xiàn)一例因臭氧中毒而導(dǎo)致死亡的報(bào)道。

臭氧具有很強(qiáng)的氧化性，除了金和鉑外，臭氧化空氣幾乎對(duì)所有的金屬都有腐蝕作用。鋁、鋅、鉛與臭氧接觸會(huì)被強(qiáng)烈氧化，但含鉻鐵合金基本上不受臭氧腐蝕。基于這一點(diǎn)，生產(chǎn)上常使用含25%Cr的鉻鐵合金（不銹鋼）來制造臭氧發(fā)生設(shè)備和加注設(shè)備中與臭氧直接接觸的部件。

臭氧對(duì)非金屬材料也有了強(qiáng)烈的腐蝕作用，即使在別處使用得相當(dāng)穩(wěn)定的聚氯乙烯塑料濾板等，在臭氧加注設(shè)備中使用不久便見疏松、開裂和穿孔。在臭氧發(fā)生設(shè)備和計(jì)量設(shè)備中，不能用普通橡膠作密封材料，必須采用耐腐蝕能力強(qiáng)的硅橡膠或耐酸橡膠等。